风湿免疫科创建于20世纪八十年代初期，成立之初就建立了独立实验室，在国内较早开展了抗核抗体、抗ENA抗体、类风湿因子、补体、免疫球蛋白定量等检查，并多次承办学习班吸引多家医院学习。随着医院整体发展，经过几代人努力，科室的医教研等均有了长足的进步。现在是首都医科大学内科学（风湿病）科学与临床专业硕士生培养点。所有医师均为硕士研究生及以上学历。风湿免疫病学专科博士4名；主任医师1名，副主任医师1名，主治医师2名，住院医师1名。

风湿免疫科设有门诊和病房，住院床位15张，出院患者600人次/年左右，病房以类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、炎症性肌病、IgG4相关疾病、血管炎、干燥综合征患者等为主。近年确立了以系统性红斑狼疮、类风湿关节炎、干燥综合征为主体的临床基础科研方向。近10年，科室承担国家自然基金2项，北京自然基金1项，中国铁路总公司纵向课题1项。北京市中医局课题1项，北京市教育委员会科技计划项目1项，首都医科大学校级基金2项，院内基金多项。